Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
2VO5


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 50 ligands in PDB entry 2VO5. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
VBZ
A
1865 20 BICYCLO[2.2.2]OCTANE-4,7,8-TRIOL
lig 2
EDO
A
1866 41,2-ETHANEDIOL
lig 3
EDO
A
1867 41,2-ETHANEDIOL
lig 4
EDO
A
1868 41,2-ETHANEDIOL
lig 5
EDO
A
1869 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
EDO
A
1870 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
A
1871 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
A
1872 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
A
1873 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
BR
A
1874 1BROMIDE ION
lig 11
BR
A
1875 1BROMIDE ION
lig 12
CL
A
1876 1CHLORIDE ION
lig 13
CL
A
1877 1CHLORIDE ION
lig 14
EDO
A
1878 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
EDO
A
1879 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
A
1880 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
EDO
A
1881 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
BR
A
1882 1BROMIDE ION
lig 19
EDO
A
1883 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
BR
A
1884 1BROMIDE ION
lig 21
EDO
A
1885 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
BR
A
1895 1BROMIDE ION
lig 23
VBZ
B
1868 20 BICYCLO[2.2.2]OCTANE-4,7,8-TRIOL
lig 24
EDO
B
1869 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
EDO
B
1870 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
EDO
B
1871 41,2-ETHANEDIOL
lig 27
EDO
B
1872 41,2-ETHANEDIOL
lig 28
EDO
B
1873 41,2-ETHANEDIOL
lig 29
EDO
B
1874 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
EDO
B
1875 41,2-ETHANEDIOL
lig 31
EDO
B
1876 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
EDO
B
1877 41,2-ETHANEDIOL
lig 33
EDO
B
1878 41,2-ETHANEDIOL
lig 34
EDO
B
1879 41,2-ETHANEDIOL
lig 35
EDO
B
1880 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
EDO
B
1881 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
B
1882 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
EDO
B
1883 41,2-ETHANEDIOL
lig 39
BR
B
1884 1BROMIDE ION
lig 40
BR
B
1885 1BROMIDE ION
lig 41
CL
B
1886 1CHLORIDE ION
lig 42
CL
B
1887 1CHLORIDE ION
lig 43
CL
B
1888 1CHLORIDE ION
lig 44
EDO
B
1889 41,2-ETHANEDIOL
lig 45
EDO
B
1890 41,2-ETHANEDIOL
lig 46
EDO
B
1891 41,2-ETHANEDIOL
lig 47
EDO
B
1892 41,2-ETHANEDIOL
lig 48
BR
B
1893 1BROMIDE ION
lig 49
BR
B
1895 1BROMIDE ION
lig 50
CL
B
1896 1CHLORIDE ION