Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
4DVO


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 292 ligands in PDB entry 4DVO. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
NI
A
401 1NICKEL (II) ION
lig 2
NI
A
402 1NICKEL (II) ION
lig 3
NI
A
403 1NICKEL (II) ION
lig 4
SOR
A
404 12SORBITOL
lig 5
DOD
A
1001 1
lig 6
DOD
A
1002 1
lig 7
DOD
A
1003 1
lig 8
DOD
A
1004 1
lig 9
DOD
A
1005 1
lig 10
DOD
A
1006 1
lig 11
DOD
A
1007 1
lig 12
DOD
A
1008 1
lig 13
DOD
A
1009 1
lig 14
DOD
A
1010 1
lig 15
DOD
A
1011 1
lig 16
DOD
A
1012 1
lig 17
DOD
A
1013 1
lig 18
DOD
A
1014 1
lig 19
DOD
A
1015 1
lig 20
DOD
A
1016 1
lig 21
DOD
A
1017 1
lig 22
DOD
A
1018 1
lig 23
DOD
A
1019 1
lig 24
DOD
A
1020 1
lig 25
DOD
A
1021 1
lig 26
DOD
A
1022 1
lig 27
DOD
A
1023 1
lig 28
DOD
A
1024 1
lig 29
DOD
A
1025 1
lig 30
DOD
A
1026 1
lig 31
DOD
A
1027 1
lig 32
DOD
A
1028 1
lig 33
DOD
A
1029 1
lig 34
DOD
A
1030 1
lig 35
DOD
A
1031 1
lig 36
DOD
A
1032 1
lig 37
DOD
A
1033 1
lig 38
DOD
A
1034 1
lig 39
DOD
A
1035 1
lig 40
DOD
A
1036 1
lig 41
DOD
A
1037 1
lig 42
DOD
A
1038 1
lig 43
DOD
A
1039 1
lig 44
DOD
A
1040 1
lig 45
DOD
A
1041 1
lig 46
DOD
A
1042 1
lig 47
DOD
A
1043 1
lig 48
DOD
A
1044 1
lig 49
DOD
A
1045 1
lig 50
DOD
A
1046 1
lig 51
DOD
A
1047 1
lig 52
DOD
A
1048 1
lig 53
DOD
A
1049 1
lig 54
DOD
A
1050 1
lig 55
DOD
A
1051 1
lig 56
DOD
A
1052 1
lig 57
DOD
A
1053 1
lig 58
DOD
A
1054 1
lig 59
DOD
A
1055 1
lig 60
DOD
A
1056 1
lig 61
DOD
A
1057 1
lig 62
DOD
A
1058 1
lig 63
DOD
A
1059 1
lig 64
DOD
A
1060 1
lig 65
DOD
A
1061 1
lig 66
DOD
A
1062 1
lig 67
DOD
A
1063 1
lig 68
DOD
A
1064 1
lig 69
DOD
A
1065 1
lig 70
DOD
A
1066 1
lig 71
DOD
A
1067 1
lig 72
DOD
A
1068 1
lig 73
DOD
A
1069 1
lig 74
DOD
A
1070 1
lig 75
DOD
A
1071 1
lig 76
DOD
A
1072 1
lig 77
DOD
A
1073 1
lig 78
DOD
A
1074 1
lig 79
DOD
A
1075 1
lig 80
DOD
A
1076 1
lig 81
DOD
A
1077 1
lig 82
DOD
A
1078 1
lig 83
DOD
A
1079 1
lig 84
DOD
A
1080 1
lig 85
DOD
A
1081 1
lig 86
DOD
A
1082 1
lig 87
DOD
A
1083 1
lig 88
DOD
A
1084 1
lig 89
DOD
A
1085 1
lig 90
DOD
A
1086 1
lig 91
DOD
A
1087 1
lig 92
DOD
A
1088 1
lig 93
DOD
A
1089 1
lig 94
DOD
A
1090 1
lig 95
DOD
A
1091 1
lig 96
DOD
A
1092 1
lig 97
DOD
A
1093 1
lig 98
DOD
A
1094 1
lig 99
DOD
A
1095 1
lig 100
DOD
A
1096 1
lig 101
DOD
A
1097 1
lig 102
DOD
A
1098 1
lig 103
DOD
A
1099 1
lig 104
DOD
A
1100 1
lig 105
DOD
A
1101 1
lig 106
DOD
A
1102 1
lig 107
DOD
A
1103 1
lig 108
DOD
A
1104 1
lig 109
DOD
A
1105 1
lig 110
DOD
A
1106 1
lig 111
DOD
A
1107 1
lig 112
DOD
A
1108 1
lig 113
DOD
A
1109 1
lig 114
DOD
A
1110 1
lig 115
DOD
A
1111 1
lig 116
DOD
A
1112 1
lig 117
DOD
A
1113 1
lig 118
DOD
A
1114 1
lig 119
DOD
A
1115 1
lig 120
DOD
A
1116 1
lig 121
DOD
A
1117 1
lig 122
DOD
A
1118 1
lig 123
DOD
A
1119 1
lig 124
DOD
A
1120 1
lig 125
DOD
A
1121 1
lig 126
DOD
A
1122 1
lig 127
DOD
A
1123 1
lig 128
DOD
A
1124 1
lig 129
DOD
A
1125 1
lig 130
DOD
A
1126 1
lig 131
DOD
A
1127 1
lig 132
DOD
A
1128 1
lig 133
DOD
A
1129 1
lig 134
DOD
A
1130 1
lig 135
DOD
A
1131 1
lig 136
DOD
A
1132 1
lig 137
DOD
A
1133 1
lig 138
DOD
A
1134 1
lig 139
DOD
A
1135 1
lig 140
DOD
A
1136 1
lig 141
DOD
A
1137 1
lig 142
DOD
A
1138 1
lig 143
DOD
A
1139 1
lig 144
DOD
A
1140 1
lig 145
DOD
A
1141 1
lig 146
DOD
A
1142 1
lig 147
DOD
A
1143 1
lig 148
DOD
A
1144 1
lig 149
DOD
A
1145 1
lig 150
DOD
A
1146 1
lig 151
DOD
A
1147 1
lig 152
DOD
A
1148 1
lig 153
DOD
A
1149 1
lig 154
DOD
A
1150 1
lig 155
DOD
A
1151 1
lig 156
DOD
A
1152 1
lig 157
DOD
A
1153 1
lig 158
DOD
A
1154 1
lig 159
DOD
A
1155 1
lig 160
DOD
A
1156 1
lig 161
DOD
A
1157 1
lig 162
DOD
A
1158 1
lig 163
DOD
A
1159 1
lig 164
DOD
A
1160 1
lig 165
DOD
A
1161 1
lig 166
DOD
A
1162 1
lig 167
DOD
A
1163 1
lig 168
DOD
A
1164 1
lig 169
DOD
A
1165 1
lig 170
DOD
A
1166 1
lig 171
DOD
A
1167 1
lig 172
DOD
A
1168 1
lig 173
DOD
A
1169 1
lig 174
DOD
A
1170 1
lig 175
DOD
A
1171 1
lig 176
DOD
A
1172 1
lig 177
DOD
A
1173 1
lig 178
DOD
A
1174 1
lig 179
DOD
A
1175 1
lig 180
DOD
A
1176 1
lig 181
DOD
A
1177 1
lig 182
DOD
A
1178 1
lig 183
DOD
A
1179 1
lig 184
DOD
A
1180 1
lig 185
DOD
A
1181 1
lig 186
DOD
A
1182 1
lig 187
DOD
A
1183 1
lig 188
DOD
A
1184 1
lig 189
DOD
A
1185 1
lig 190
DOD
A
1186 1
lig 191
DOD
A
1187 1
lig 192
DOD
A
1188 1
lig 193
DOD
A
1189 1
lig 194
DOD
A
1190 1
lig 195
DOD
A
1191 1
lig 196
DOD
A
1192 1
lig 197
DOD
A
1193 1
lig 198
DOD
A
1194 1
lig 199
DOD
A
1195 1
lig 200
DOD
A
1196 1
lig 201
DOD
A
1197 1
lig 202
DOD
A
1198 1
lig 203
DOD
A
1199 1
lig 204
DOD
A
1200 1
lig 205
DOD
A
1201 1
lig 206
DOD
A
1202 1
lig 207
DOD
A
1203 1
lig 208
DOD
A
1204 1
lig 209
DOD
A
1205 1
lig 210
DOD
A
1206 1
lig 211
DOD
A
1207 1
lig 212
DOD
A
1208 1
lig 213
DOD
A
1209 1
lig 214
DOD
A
1210 1
lig 215
DOD
A
1211 1
lig 216
DOD
A
1212 1
lig 217
DOD
A
1213 1
lig 218
DOD
A
1214 1
lig 219
DOD
A
1215 1
lig 220
DOD
A
1216 1
lig 221
DOD
A
1217 1
lig 222
DOD
A
1218 1
lig 223
DOD
A
1219 1
lig 224
DOD
A
1220 1
lig 225
DOD
A
1221 1
lig 226
DOD
A
1222 1
lig 227
DOD
A
1223 1
lig 228
DOD
A
1224 1
lig 229
DOD
A
1225 1
lig 230
DOD
A
1226 1
lig 231
DOD
A
1227 1
lig 232
DOD
A
1228 1
lig 233
DOD
A
1229 1
lig 234
DOD
A
1230 1
lig 235
DOD
A
1231 1
lig 236
DOD
A
1232 1
lig 237
DOD
A
1233 1
lig 238
DOD
A
1234 1
lig 239
DOD
A
1235 1
lig 240
DOD
A
1236 1
lig 241
DOD
A
1237 1
lig 242
DOD
A
1238 1
lig 243
DOD
A
1239 1
lig 244
DOD
A
1240 1
lig 245
DOD
A
1241 1
lig 246
DOD
A
1242 1
lig 247
DOD
A
1243 1
lig 248
DOD
A
1244 1
lig 249
DOD
A
1245 1
lig 250
DOD
A
1246 1
lig 251
DOD
A
1247 1
lig 252
DOD
A
1248 1
lig 253
DOD
A
1249 1
lig 254
DOD
A
1250 1
lig 255
DOD
A
1251 1
lig 256
DOD
A
1252 1
lig 257
DOD
A
1253 1
lig 258
DOD
A
1254 1
lig 259
DOD
A
1255 1
lig 260
DOD
A
1256 1
lig 261
DOD
A
1257 1
lig 262
DOD
A
1258 1
lig 263
DOD
A
1259 1
lig 264
DOD
A
1260 1
lig 265
DOD
A
1261 1
lig 266
DOD
A
1262 1
lig 267
DOD
A
1263 1
lig 268
DOD
A
1264 1
lig 269
DOD
A
1265 1
lig 270
DOD
A
1266 1
lig 271
DOD
A
1267 1
lig 272
DOD
A
1268 1
lig 273
DOD
A
1269 1
lig 274
DOD
A
1270 1
lig 275
DOD
A
1271 1
lig 276
DOD
A
1272 1
lig 277
DOD
A
1273 1
lig 278
DOD
A
1274 1
lig 279
DOD
A
1275 1
lig 280
DOD
A
1276 1
lig 281
DOD
A
1277 1
lig 282
DOD
A
1278 1
lig 283
DOD
A
1279 1
lig 284
DOD
A
1280 1
lig 285
DOD
A
1281 1
lig 286
DOD
A
1282 1
lig 287
DOD
A
1283 1
lig 288
DOD
A
1284 1
lig 289
DOD
A
1285 1
lig 290
DOD
A
1286 1
lig 291
DOD
A
1287 1
lig 292
DOD
A
1288 1