Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
4YHF


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 44 ligands in PDB entry 4YHF. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
4C9
A
701 39 YL}CARBONYL)-4,4-DIMETHYLPENTANENITRILE
lig 2
NA
A
702 1SODIUM ION
lig 3
NA
A
703 1SODIUM ION
lig 4
NA
A
704 1SODIUM ION
lig 5
NA
A
705 1SODIUM ION
lig 6
NA
A
706 1SODIUM ION
lig 7
NA
A
707 1SODIUM ION
lig 8
NA
A
708 1SODIUM ION
lig 9
NA
A
709 1SODIUM ION
lig 10
EDO
A
710 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
EDO
A
711 41,2-ETHANEDIOL
lig 12
SO4
A
712 5SULFATE ION
lig 13
SO4
A
713 5SULFATE ION
lig 14
CL
A
714 1CHLORIDE ION
lig 15
CL
A
715 1CHLORIDE ION
lig 16
CL
A
716 1CHLORIDE ION
lig 17
NA
A
717 1SODIUM ION
lig 18
NA
B
701 1SODIUM ION
lig 19
NA
B
702 1SODIUM ION
lig 20
4C9
B
703 39 YL}CARBONYL)-4,4-DIMETHYLPENTANENITRILE
lig 21
NA
B
704 1SODIUM ION
lig 22
NA
B
705 1SODIUM ION
lig 23
NA
B
706 1SODIUM ION
lig 24
NA
B
707 1SODIUM ION
lig 25
NA
B
708 1SODIUM ION
lig 26
NA
B
709 1SODIUM ION
lig 27
NA
B
710 1SODIUM ION
lig 28
NA
B
711 1SODIUM ION
lig 29
NA
B
712 1SODIUM ION
lig 30
NA
B
713 1SODIUM ION
lig 31
NA
B
714 1SODIUM ION
lig 32
NA
B
715 1SODIUM ION
lig 33
NA
B
716 1SODIUM ION
lig 34
EDO
B
717 41,2-ETHANEDIOL
lig 35
EDO
B
718 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
EDO
B
719 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
B
720 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
EDO
B
721 41,2-ETHANEDIOL
lig 39
EDO
B
722 41,2-ETHANEDIOL
lig 40
SO4
B
723 5SULFATE ION
lig 41
CL
B
724 1CHLORIDE ION
lig 42
CL
B
725 1CHLORIDE ION
lig 43
CL
B
726 1CHLORIDE ION
lig 44
CL
B
727 1CHLORIDE ION