Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
5NC5


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 53 ligands in PDB entry 5NC5. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
LMT
A
1101 24DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE
lig 2
LMT
A
1102 12DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE
lig 3
D12
A
1103 12DODECANE
lig 4
D10
A
1104 10DECANE
lig 5
D10
A
1105 10DECANE
lig 6
D10
A
1106 10DECANE
lig 7
DD9
A
1107 9NONANE
lig 8
D10
A
1108 10DECANE
lig 9
D10
A
1109 10DECANE
lig 10
DD9
A
1110 5NONANE
lig 11
LMT
A
1111 12DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE
lig 12
D12
A
1112 12DODECANE
lig 13
DD9
A
1113 7NONANE
lig 14
DD9
A
1114 9NONANE
lig 15
D10
B
1101 10DECANE
lig 16
DD9
B
1102 5NONANE
lig 17
D10
B
1103 10DECANE
lig 18
D12
B
1104 9DODECANE
lig 19
D10
B
1105 10DECANE
lig 20
DD9
B
1106 7NONANE
lig 21
DD9
B
1107 6NONANE
lig 22
D10
B
1108 10DECANE
lig 23
DD9
B
1109 9NONANE
lig 24
D10
B
1110 10DECANE
lig 25
D10
B
1111 10DECANE
lig 26
DD9
B
1112 7NONANE
lig 27
D10
B
1113 10DECANE
lig 28
D10
B
1114 10DECANE
lig 29
DD9
B
1115 6NONANE
lig 30
D10
B
1116 10DECANE
lig 31
D10
B
1117 10DECANE
lig 32
D10
B
1118 10DECANE
lig 33
DD9
B
1119 9NONANE
lig 34
PUY
B
1120 34PUROMYCIN
lig 35
D12
B
1121 11DODECANE
lig 36
D10
B
1122 10DECANE
lig 37
DD9
C
1101 4NONANE
lig 38
D10
C
1102 10DECANE
lig 39
D12
C
1103 12DODECANE
lig 40
D10
C
1104 10DECANE
lig 41
HEX
C
1105 6HEXANE
lig 42
D12
C
1106 12DODECANE
lig 43
D12
C
1107 12DODECANE
lig 44
D12
C
1108 5DODECANE
lig 45
DD9
C
1109 6NONANE
lig 46
DD9
C
1110 8NONANE
lig 47
D10
C
1111 10DECANE
lig 48
D10
C
1112 10DECANE
lig 49
D10
C
1113 10DECANE
lig 50
D10
C
1114 10DECANE
lig 51
D10
C
1115 10DECANE
lig 52
D10
C
1116 10DECANE
lig 53
D10
C
1117 10DECANE