2UXB | Ribosome | date | Mar 28, 2007 |
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title | Crystal Structure Of An Extended Trna Anticodon Stem Loop In With Its Cognate Mrna Gggu In The Context Of The Thermus Th 30s Subunit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | C.M.Dunham, M.Selmer, S.S.Phelps, A.C.Kelley, T.Suzuki, S.Joseph, V.Ramakrishnan | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 16s Ribosomal Rna Chain: A Other_details: Chain A (16s Rna) Has E. Coli Numbering |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S2 Chain: B |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S3 Chain: C |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S4 Chain: D |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S5 Chain: E |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S6 Chain: F |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S7 Chain: G |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S8 Chain: H |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S9 Chain: I |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S10 Chain: J |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S11 Chain: K |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S12 Chain: L |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S13 Chain: M |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S14 Chain: N |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S15 Chain: O |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S16 Chain: P |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S17 Chain: Q |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S18 Chain: R |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S19 Chain: S |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S20 Chain: T |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein Thx Chain: U |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: A-Site Messenger Rna Fragment Gggu Chain: X Engineered: Yes |
Synthetic: Yes Organism_scientific: Synthetic Construct Organism_taxid: 32630 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Anticodon Stem-Loop Of Transfer Rna With Anticodo Chain: Y Engineered: Yes Other_details: Sequence Based On E.Coli Trnaphe With Extend Anticodon |
Synthetic: Yes Organism_scientific: Synthetic Construct Organism_taxid: 32630 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: P 41 21 2 |
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crystal cell |
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method | X-Ray Diffraction | resolution | 3.10 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | K, MG, PAR, ZN | enzyme |
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Gene Ontology |
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Primary reference | Structures of tRNAs with an expanded anticodon loop in the decoding center of the 30S ribosomal subunit., Dunham CM, Selmer M, Phelps SS, Kelley AC, Suzuki T, Joseph S, Ramakrishnan V, RNA. 2007 Jun;13(6):817-23. Epub 2007 Apr 6. PMID:17416634 |
OCA© by Jaime Prilusky, 1996-2014,2022 Bioinformatics Unit Weizmann Institute of Science |