5MY1 | Ribosome | date | Jan 25, 2017 |
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title | E. Coli Expressome | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | R.Kohler, R.A.Mooney, D.J.Mills, D.Kostrewa, R.Landick, P.Cramer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 16s Ribosomal Rna Chain: A |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S3 Chain: C |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S4 Chain: D |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S5 Chain: E |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S6 Chain: F |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S7 Chain: G |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S8 Chain: H |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S9 Chain: I |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S10 Chain: J |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S11 Chain: K |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S12 Chain: L |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S13 Chain: M |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S14 Chain: N |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S15 Chain: O |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S16 Chain: P |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S17 Chain: Q |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S18 Chain: R |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S19 Chain: S |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S20 Chain: T |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S2 Chain: B |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S21 Chain: U |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase Subunit Alpha Chain: V, W Synonym: Rnap Subunit Alpha,Rna Polymerase Subunit Alpha, Transcriptase Subunit Alpha; Ec: 2.7.7.6 Engineered: Yes |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 Gene: Rpoa, Pez, Phs, Sez, B3295, Jw3257 Expression_system: Escherichia Coli Expression_system_taxid: 562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase Subunit Beta Chain: X Synonym: Rnap Subunit Beta,Rna Polymerase Subunit Beta,Tran Subunit Beta; Ec: 2.7.7.6 Engineered: Yes |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 Gene: Rpob, Ecdh10b_4175 Expression_system: Escherichia Coli Expression_system_taxid: 562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase Subunit Beta' Chain: Y Synonym: Rnap Subunit Beta',Rna Polymerase Subunit Beta', Transcriptase Subunit Beta'; Ec: 2.7.7.6 Engineered: Yes |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 Gene: Rpoc, Tabb, B3988, Jw3951 Expression_system: Escherichia Coli Expression_system_taxid: 562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase Subunit Omega Chain: Z Synonym: Rnap Omega Subunit,Rna Polymerase Omega Subunit, Transcriptase Subunit Omega; Ec: 2.7.7.6 Engineered: Yes |
Organism_scientific: Escherichia Coli K-12 Organism_taxid: 83333 Gene: Rpoz, Ecdh10b_3831 Expression_system: Escherichia Coli Expression_system_taxid: 562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: P 1 |
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crystal cell |
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method | Electron Microscopy | resolution | 7.60 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | ZN | enzyme | Transferase E.C.2.7.7.6 BRENDA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene | ECDH10B ; ECDH10B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology |
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Primary reference | Architecture of a transcribing-translating expressome., Kohler R, Mooney RA, Mills DJ, Landick R, Cramer P, Science. 2017 Apr 14;356(6334):194-197. doi: 10.1126/science.aal3059. PMID:28408604 |
Data retrieval |
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