2HHH | Ribosome | date | Jun 28, 2006 |
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title | Crystal Structure Of Kasugamycin Bound To The 30s Ribosomal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | F.Schluenzen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 16s Ribosomal Rna Chain: A |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S2 Chain: B |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S3 Chain: C |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S4 Chain: D |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S5 Chain: E Synonym: Ts9 |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S6 Chain: F |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S7 Chain: G |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S8 Chain: H |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S9 Chain: I |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S10 Chain: J |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S11 Chain: K |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S12 Chain: L |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S13 Chain: M |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S14 Chain: N |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S15 Chain: O |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S16 Chain: P |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S17 Chain: Q |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S18 Chain: R |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S19 Chain: S |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S20 Chain: T |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein Thx Chain: U |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: P 41 21 2 |
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crystal cell |
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method | X-Ray Diffraction | resolution | 3.35 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | KSG | enzyme |
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Gene Ontology |
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Primary reference | The antibiotic kasugamycin mimics mRNA nucleotides to destabilize tRNA binding and inhibit canonical translation initiation., Schluenzen F, Takemoto C, Wilson DN, Kaminishi T, Harms JM, Hanawa-Suetsugu K, Szaflarski W, Kawazoe M, Shirouzo M, Nierhaus KH, Yokoyama S, Fucini P, Nat Struct Mol Biol. 2006 Oct;13(10):871-8. Epub 2006 Sep 24. PMID:16998488 |
OCA© by Jaime Prilusky, 1996-2014,2022 Bioinformatics Unit Weizmann Institute of Science |