2YBB | Oxidoreductase | date | Mar 02, 2011 |
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title | Fitted Model For Bovine Mitochondrial Supercomplex I1iii2iv1 Particle Cryo-Em (Emd-1876) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | T.Althoff, D.J.Mills, J.L.Popot, W.Kuehlbrandt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Nadh-Quinone Oxidoreductase Subunit 1 Chain: 1 Synonym: Nadh Dehydrogenase I Chain 1, Ndh-1 Subunit 1 Ec: 1.6.99.5 Other_details: Nqo1 (51kda) |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27624 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Nadh-Quinone Oxidoreductase Subunit 2 Chain: 2 Synonym: Nadh Dehydrogenase I Chain 2, Ndh-1 Subunit 2 Ec: 1.6.99.5 Other_details: Nqo2 (24kda) |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27624 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Nadh-Quinone Oxidoreductase Subunit 3 Chain: 3 Synonym: Nadh Dehydrogenase I Chain 3, Ndh-1 Subunit 3 Ec: 1.6.99.5 Other_details: Nqo3 (75kda) |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27624 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Nadh-Quinone Oxidoreductase Subunit 4 Chain: 4 Synonym: Nadh Dehydrogenase I Chain 4, Ndh-1 Subunit 4 Ec: 1.6.99.5 Other_details: Nqo4 (49kda) |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27624 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Nadh-Quinone Oxidoreductase Subunit 5 Chain: 5 Synonym: Nadh Dehydrogenase I Chain 5, Ndh-1 Subunit 5 Ec: 1.6.99.5 Other_details: Nqo5 (30kda) |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27624 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Nadh-Quinone Oxidoreductase Subunit 6 Chain: 6 Synonym: Nadh Dehydrogenase I Subunit 6, Ndh-1 Subunit 6 Ec: 1.6.99.5 Other_details: Nqo6 (Psst) |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27624 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Nadh-Quinone Oxidoreductase Subunit 15 Chain: 7 Synonym: Nadh Dehydrogenase I Chain 15, Ndh-1 Subunit 15 Ec: 1.6.99.5 Other_details: Nqo15 |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27624 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Nadh-Quinone Oxidoreductase Subunit 9 Chain: 8 Synonym: Nadh Dehydrogenase I Subunit 9, Ndh-1 Subunit 9 Ec: 1.6.99.5 Other_details: Nqo9 (Tyky) |
Organism_scientific: Thermus Thermophilus Organism_taxid: 300852 Strain: Hb8 Atcc: 27624 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome B-C1 Complex Subunit 1, Mitochondrial Chain: A, a Synonym: Complex III Subunit 1, Core Protein I, Ubiquinol-C C Reductase Complex Core Protein 1; Ec: 1.10.2.2 |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome B-C1 Complex Subunit 2, Mitochondrial Chain: B, b Synonym: Complex III Subunit 2, Core Protein II, Ubiquinol- Cytochrome-C Reductase Complex Core Protein 2; Ec: 1.10.2.2 |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome B Chain: C, c Synonym: Complex III Subunit 3, Complex III Subunit III, Cy B-C1 Complex Subunit 3, Ubiquinol-Cytochrome-C Reductase Co Cytochrome B Subunit; Ec: 1.10.2.2 |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome C1, Heme Protein, Mitochondrial Chain: D, d Fragment: Residues 85-325 Synonym: Complex III Subunit 4, Complex III Subunit Iv, Cyt C1 Complex Subunit 4, Ubiquinol-Cytochrome-C Reductase Comp Cytochrome C1 Subunit; Ec: 1.10.2.2 |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome B-C1 Complex Subunit Rieske, Mitochond Chain: E, e Synonym: Complex III Subunit 5, Cytochrome B-C1 Complex Sub Rieske Iron-Sulfur Protein, Ubiquinol-Cytochrome C Reductas Sulfur Subunit; Ec: 1.10.2.2 |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome B-C1 Complex Subunit 7 Chain: F, f Synonym: Complex III Subunit 7, Ubiquinol-Cytochrome C Redu Complex 14 Kda Protein, Complex III Subunit Vii; Ec: 1.10.2.2 Mutation: Yes |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome B-C1 Complex Subunit 8 Chain: G, g Synonym: Complex III Subunit 8, Complex III Subunit Viii, U Cytochrome C Reductase Complex 9.5 Kda Protein, Ubiquinol-C C Reductase Complex Ubiquinone-Binding Protein Qp-C; Ec: 1.10.2.2 |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome B-C1 Complex Subunit 6, Mitochondrial Chain: H, h Synonym: Complex III Subunit 6, Complex III Subunit Viii, C C1 Non-Heme 11 Kda Protein, Mitochondrial Hinge Protein, Ub Cytochrome C Reductase Complex 11 Kda Protein; Ec: 1.10.2.2 |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome B-C1 Complex Subunit Rieske, Mitochond Chain: I, I Synonym: Complex III Subunit 5, Cytochrome B-C1 Complex Sub Rieske Iron-Sulfur Protein, Ubiquinol-Cytochrome C Reductas Sulfur Subunit, Cytochrome B-C1 Complex Subunit 11, Complex Subunit Ix, Ubiquinol-Cytochrome C Reductase 8 Kda Protein, Ec: 1.10.2.2 |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome B-C1 Complex Subunit 9 Chain: J, j Synonym: Complex III Subunit 9, Complex III Subunit X, Cyto Non-Heme 7 Kda Protein, Ubiquinol-Cytochrome C Reductase Co Kda Protein; Ec: 1.10.2.2 |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome B-C1 Complex Subunit 10 Chain: K, k Synonym: Complex III Subunit 10, Complex III Subunit Xi, Ub Cytochrome C Reductase Complex 6.4 Kda Protein; Ec: 1.10.2.2 |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome C Oxidase Subunit 1 Chain: L Synonym: Cytochrome C Oxidase Polypeptide I Ec: 1.9.3.1 |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome C Oxidase Subunit 2 Chain: M Synonym: Cytochrome C Oxidase Polypeptide II Ec: 1.9.3.1 |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome C Oxidase Subunit 3 Chain: N Synonym: Cytochrome C Oxidase Polypeptide III Ec: 1.9.3.1 |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome C Oxidase Subunit 4 Isoform 1, Mitocho Chain: O Synonym: Cytochrome C Oxidase Polypeptide Iv, Cytochrome C Subunit Iv Isoform 1, Cox Iv-1; Ec: 1.9.3.1 |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome C Oxidase Subunit 5a, Mitochondrial Chain: P Synonym: Cytochrome C Oxidase Polypeptide Va Ec: 1.9.3.1 |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome C Oxidase Subunit 5b, Mitochondrial Chain: Q Synonym: Cytochrome C Oxidase Polypeptide Via, Cytochrome C Polypeptide Vb; Ec: 1.9.3.1 |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome C Oxidase Polypeptide Via, Cytochrome Polypeptide Vb; Chain: R Synonym: Cytochrome C Oxidase Polypeptide Via-Heart, Cytoch Oxidase Polypeptide Vib, Coxviah; Ec: 1.9.3.1 |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome C Oxidase Subunit 6b1 Chain: S Synonym: Cytochrome C Oxidase Polypeptide Vii, Cytochrome C Subunit Aed, Cytochrome C Oxidase Subunit Vib Isoform 1, Co Ec: 1.9.3.1 |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome C Oxidase Subunit 6c Chain: T Synonym: Cytochrome C Oxidase Polypeptide Vic, Cytochrome C Subunit Sta; Ec: 1.9.3.1 |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome C Oxidase Subunit 7a1, Mitochondrial Chain: U Synonym: Cytochrome C Oxidase Subunit Viiic, Cytochrome C O Subunit Viia-Heart, Cytochrome C Oxidase Subunit Viia-Muscl Cytochrome C Oxidase Subunit Viia-H, Cytochrome C Oxidase S Viia-M; Ec: 1.9.3.1 |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome C Oxidase Subunit 7b, Mitochondrial Chain: V Synonym: Cytochrome C Oxidase Polypeptide Viib, Ihq Ec: 1.9.3.1 |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome C Oxidase Subunit 7c, Mitochondrial Chain: W Synonym: Cytochrome C Oxidase Polypeptide Viiia, Cytochrome Polypeptide Viic; Ec: 1.9.3.1 |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome C Oxidase Subunit 8b, Mitochondrial Chain: X Synonym: Cytochrome C Oxidase Polypeptide Viii-Heart, Cytoc Oxidase Subunit 8-1, Cytochrome C Oxidase Subunit 8h, Ix, V Ec: 1.9.3.1 |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome C Chain: Y |
Organism_scientific: Bos Taurus Organism_common: Cattle Organism_taxid: 9913 Organ: Heart Tissue: Muscle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Nadh\: Ubiquinone Oxidoreductase, Membrane Subuni Chain: m Ec: 1.6.5.3 Other_details: Subunit Nuol (Chain5) |
Organism_scientific: Escherichia Coli Organism_taxid: 511693 Strain: Bl21 Atcc: Baa-1025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Nadh\: Ubiquinone Oxidoreductase, Membrane Subuni Chain: n Synonym: Subunit Of Nadh\: Ubiquinone Oxidoreductase I Ec: 1.6.5.3 Other_details: Subunit Nuom (Chain4) |
Organism_scientific: Escherichia Coli Organism_taxid: 511693 Strain: Bl21 Atcc: Baa-1025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Nadh-Quinone Oxidoreductase Subunit N Chain: o Synonym: Nadh Dehydrogenase I Subunit N, Ndh-1 Subunit N Ec: 1.6.5.3 Other_details: Subunit Nuon (Chain2) |
Organism_scientific: Escherichia Coli Organism_taxid: 511693 Strain: Bl21 Atcc: Baa-1025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Nadh-Quinone Oxidoreductase Subunit K Chain: p Synonym: Nadh Dehydrogenase I Subunit K, Ndh-1 Subunit K Ec: 1.6.5.3 Other_details: Subunits Nuoa, J And K (Chain3,6 And 4l) |
Organism_scientific: Escherichia Coli Organism_taxid: 511693 Strain: Bl21 Atcc: Baa-1025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: P 1 |
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crystal cell |
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method | Electron Microscopy | resolution | 19.00 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | CA, CDL, CU, FES, FMN, HEA, HEC, HEM, MG, NAI, SF4, SMA, UQ1, ZN | enzyme | Oxidoreductase E.C.1.6.99.5 BRENDA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology |
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Primary reference | Arrangement of electron transport chain components in bovine mitochondrial supercomplex I(1)III(2)IV(1)., Althoff T, Mills DJ, Popot JL, Kuhlbrandt W, EMBO J. 2011 Sep 9. doi: 10.1038/emboj.2011.324. PMID:21909073 |
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