3I55 | Ribosome Antibiotic | date | Jul 03, 2009 |
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title | Co-Crystal Structure Of Mycalamide A Bound To The Large Ribo Subunit | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | G.Gurel, G.Blaha, T.A.Steitz, P.B.Moore | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 23s Ribosomal Rna Chain |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Atcc 43049 Organism_taxid: 272569 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L2p Chain: A Synonym: Hmal2, Hl4 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L3p Chain: B Synonym: Hmal3, Hl1 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L4p Chain: C Synonym: Hmal4, Hl6 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L5p Chain: D Synonym: Hmal5, Hl13 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L6p Chain: E Synonym: Hmal6, Hl10 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L7ae Chain: F Synonym: Hs6 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L10e Chain: G Synonym: Ribosomal Protein L10, Acidic Ribosomal Protein P0 L10e, Hmal10; |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L10e Chain: H |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L11p Chain: I Synonym: Hmal11 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L13p Chain: J Synonym: Hmal13 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L14p Chain: K Synonym: Hmal14, Hl27 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L15p Chain: L Synonym: Hmal15, Hl9 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L15e Chain: M Synonym: 50s Ribosomal Protein Lc12 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L18p Chain: N Synonym: Hmal18, Hl12 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L18e Chain: O Synonym: Hl29, L19 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L19e Chain: P Synonym: Hmal19, Hl24 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L21e Chain: Q Synonym: Hl31 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L22p Chain: R Synonym: Hmal22, Hl23 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L23p Chain: S Synonym: Hmal23, Hl25, L21 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L24p Chain: T Synonym: Hmal24, Hl16, Hl15 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L24e Chain: U Synonym: Hl21hl22 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L29p Chain: V Synonym: Hmal29, Hl33 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L30p Chain: W Synonym: Hmal30, Hl20, Hl16 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L31e Chain: X Synonym: L34, Hl30 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L32e Chain: Y Synonym: Hl5 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L37ae Chain: Z |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L37e Chain: 1 Synonym: L35e |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L39e Chain: 2 Synonym: Hl39e, Hl46e |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L44e Chain: 3 Synonym: La, Hla |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_common: Halobacterium Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 5s Ribosomal Rna Chain: 9 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dnarna (5'-R(Cpcp(5aa)P(2op)P(Po2)Papcpc Chain: 4 Engineered: Yes |
Synthetic: Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: C 2 2 21 |
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crystal cell |
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method | X-Ray Diffraction | resolution | 3.11 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | 1MA, 2OP, 5AA, CD, CL, K, MG, MYL, NA, OMG, OMU, PO2, PSU, SR, UR3 | enzyme |
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Gene Ontology |
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Primary reference | Structures of triacetyloleandomycin and mycalamide A bind to the large ribosomal subunit of Haloarcula marismortui., Gurel G, Blaha G, Steitz TA, Moore PB, Antimicrob Agents Chemother. 2009 Dec;53(12):5010-4. Epub 2009 Sep 8. PMID:19738021 |
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