5MDX | Photosynthesis | date | Nov 13, 2016 |
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title | Cryo-Em Structure Of The Psii Supercomplex From Arabidopsis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | L.S.Van Bezouwen, S.Caffarri, R.S.Kale, R.Kouril, A.M.W.H.Thunni G.T.Oostergetel, E.J.Boekema | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Protein D1 Chain: A, a Synonym: Psii D1 Protein,Photosystem II Q(B) Protein Ec: 1.10.3.9 |
Organism_scientific: Arabidopsis Thaliana Organism_common: Mouse-Ear Cress Organism_taxid: 3702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Cp47 Reaction Center Protein Chain: B, b Synonym: Psii 47 Kda Protein,Protein Cp-47 |
Organism_scientific: Arabidopsis Thaliana Organism_common: Mouse-Ear Cress Organism_taxid: 3702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Cp43 Reaction Center Protein Chain: C, c Synonym: Psii 43 Kda Protein,Protein Cp-43 |
Organism_scientific: Arabidopsis Thaliana Organism_common: Mouse-Ear Cress Organism_taxid: 3702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II D2 Protein Chain: D, d Synonym: Psii D2 Protein,Photosystem Q(A) Protein Ec: 1.10.3.9 |
Organism_scientific: Arabidopsis Thaliana Organism_common: Mouse-Ear Cress Organism_taxid: 3702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome B559 Subunit Alpha Chain: E, e Synonym: Psii Reaction Center Subunit V |
Organism_scientific: Arabidopsis Thaliana Organism_common: Mouse-Ear Cress Organism_taxid: 3702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome B559 Subunit Beta (Psbf) Chain: F, f |
Organism_scientific: Arabidopsis Thaliana Organism_common: Mouse-Ear Cress Organism_taxid: 3702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Reaction Center Protein H Chain: H, h Synonym: Psii-H,Photosystem II 10 Kda Phosphoprotein |
Organism_scientific: Arabidopsis Thaliana Organism_common: Mouse-Ear Cress Organism_taxid: 3702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Reaction Center Protein I Chain: I, I Synonym: Psii-I,Psii 4.8 Kda Protein |
Organism_scientific: Arabidopsis Thaliana Organism_common: Mouse-Ear Cress Organism_taxid: 3702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Reaction Center Protein K Chain: K, k Synonym: Psii-K |
Organism_scientific: Arabidopsis Thaliana Organism_common: Mouse-Ear Cress Organism_taxid: 3702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Reaction Center Protein L Chain: L, l Synonym: Psii-L |
Organism_scientific: Arabidopsis Thaliana Organism_common: Mouse-Ear Cress Organism_taxid: 3702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Reaction Center Protein M Chain: M, m Synonym: Psii-M |
Organism_scientific: Arabidopsis Thaliana Organism_common: Mouse-Ear Cress Organism_taxid: 3702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Oxygen-Evolving Enhancer Protein 1-1, Chloroplast Chain: O, o Synonym: Oee1,33 Kda Subunit Of Oxygen Evolving System Of P II,33 Kda Thylakoid Membrane Protein,Manganese-Stabilizing Msp-1,Oec 33 Kda Subunit; |
Organism_scientific: Arabidopsis Thaliana Organism_common: Mouse-Ear Cress Organism_taxid: 3702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Reaction Center Protein T Chain: T, t Synonym: Psii-T |
Organism_scientific: Arabidopsis Thaliana Organism_common: Mouse-Ear Cress Organism_taxid: 3702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Reaction Center W Protein, Chlorop Chain: W, w Synonym: Psii 6.1 Kda Protein |
Organism_scientific: Arabidopsis Thaliana Organism_common: Mouse-Ear Cress Organism_taxid: 3702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Reaction Center Protein X Chain: X, x Synonym: Psbx,Photosystem II Subunit X,Putative Psii-X Prot Putative Uncharacterized Protein At2g06520; T12h3.7; |
Organism_scientific: Arabidopsis Thaliana Organism_common: Mouse-Ear Cress Organism_taxid: 3702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Reaction Center Protein Z Chain: Z, z Synonym: Psii-Z |
Organism_scientific: Arabidopsis Thaliana Organism_common: Mouse-Ear Cress Organism_taxid: 3702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Chlorophyll A-B Binding Protein Cp29.1, Chloropla Chain: R, r Synonym: Lhcb4.1,Lhcii Protein 4.1 |
Organism_scientific: Arabidopsis Thaliana Organism_common: Mouse-Ear Cress Organism_taxid: 3702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Chlorophyll A-B Binding Protein Cp26, Chloroplast Chain: S, s Synonym: Lhcb5,Lhciic,Light-Harvesting Complex II Protein 5 |
Organism_scientific: Arabidopsis Thaliana Organism_common: Mouse-Ear Cress Organism_taxid: 3702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Chlorophyll A-B Binding Protein 1, Chloroplastic Chain: G, N, Y, g, n, y, 1, 2, 3, 5, 6, 7 Synonym: Chlorophyll A-B Protein 140,Cab-140,Lhcii Type I C |
Organism_scientific: Arabidopsis Thaliana Organism_common: Mouse-Ear Cress Organism_taxid: 3702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Chlorophyll A-B Binding Protein, Chloroplastic Chain: 4, 8 |
Organism_scientific: Arabidopsis Thaliana Organism_common: Mouse-Ear Cress Organism_taxid: 3702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: P 1 |
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crystal cell |
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method | Electron Microscopy | resolution | 5.30 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | CHL, CLA, FE2, HEM, PHO | enzyme | Oxidoreductase E.C.1.10.3.9 BRENDA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology |
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Primary reference | Subunit and chlorophyll organization of the plant photosystem II supercomplex., van Bezouwen LS, Caffarri S, Kale RS, Kouril R, Thunnissen AWH, Oostergetel GT, Boekema EJ, Nat Plants. 2017 Jun 12;3:17080. doi: 10.1038/nplants.2017.80. PMID:28604725 |
OCA© by Jaime Prilusky, 1996-2014,2022 Bioinformatics Unit Weizmann Institute of Science |